Jens Hainmueller es profesor en el Departamento de Ciencias Políticas de la Universidad de Stanford y tiene un nombramiento de cortesía en la Escuela de Graduados en Negocios de Stanford. También es codirector de la facultad del Laboratorio de Políticas de Inmigración de Stanford, que se centra en el diseño y la evaluación de políticas y programas de inmigración e integración.

Sus intereses de investigación incluyen inmigración, métodos estadísticos, economía política y comportamiento político. Ha publicado más de 65 artículos, muchos de ellos en las principales revistas científicas generales y en las principales revistas de campo de ciencias políticas, estadísticas, economía y negocios. También ha publicado tres paquetes de software de código abierto y su investigación ha recibido premios y financiación de Carnegie Corporation, Russell Sage Foundation, Robin Hood Foundation, National Science Foundation, Swiss SNF, American Political Science Association, Schmidt Futures, la Sociedad de Metodología Política, la Oficina Nacional de Investigación Económica y la Asociación de Ciencias Políticas del Medio Oeste.

Hainmueller recibió su doctorado de la Universidad de Harvard y también estudió en la Escuela de Economía de Londres, la Universidad de Brown y la Universidad de Tübingen. Antes de unirse a Stanford, formó parte de la facultad del Instituto de Tecnología de Massachusetts.