Como parte de los Institutos Nacionales de Salud, el Dr. Aldaba está involucrado en investigaciones sobre varios temas de salud pública como tuberculosis, abuso infantil, prácticas de inmunización y enfermedades prevenibles por vacunación como la encefalitis japonesa, la rubéola y el dengue. Ha estado involucrada en la realización de varios ensayos clínicos y programas de promoción sobre el abandono del hábito de fumar, el control de la tuberculosis y el desarrollo temprano de la alfabetización pediátrica.